MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.01

Total Repeats: 1247

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019727	CTGTA	2	10	109	118	20 %	40 %	20 %	20 %	428303472
2	NC_019727	CATT	2	8	148	155	25 %	50 %	0 %	25 %	428303472
3	NC_019727	TCG	2	6	177	182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303472
4	NC_019727	T	6	6	209	214	0 %	100 %	0 %	0 %	428303472
5	NC_019727	AGA	2	6	271	276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303472
6	NC_019727	CAT	2	6	404	409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303472
7	NC_019727	TTA	2	6	463	468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303472
8	NC_019727	GAA	2	6	475	480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303472
9	NC_019727	ACG	2	6	506	511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303472
10	NC_019727	TTTG	2	8	513	520	0 %	75 %	25 %	0 %	428303472
11	NC_019727	GCA	2	6	624	629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303472
12	NC_019727	GCTG	2	8	1275	1282	0 %	25 %	50 %	25 %	428303473
13	NC_019727	TTA	2	6	1338	1343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303473
14	NC_019727	TGG	2	6	1375	1380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303473
15	NC_019727	TTGA	2	8	1419	1426	25 %	50 %	25 %	0 %	428303473
16	NC_019727	ACT	2	6	1488	1493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303473
17	NC_019727	CTG	2	6	1573	1578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303473
18	NC_019727	ACA	2	6	1676	1681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303473
19	NC_019727	ATT	2	6	1686	1691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303473
20	NC_019727	TCA	2	6	1793	1798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303474
21	NC_019727	GAA	2	6	1858	1863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303474
22	NC_019727	CAG	2	6	1865	1870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303474
23	NC_019727	GT	3	6	1880	1885	0 %	50 %	50 %	0 %	428303474
24	NC_019727	TCA	2	6	1918	1923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303474
25	NC_019727	TAA	2	6	2031	2036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303474
26	NC_019727	A	6	6	2035	2040	100 %	0 %	0 %	0 %	428303474
27	NC_019727	GAA	2	6	2080	2085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303474
28	NC_019727	TGGAA	2	10	2088	2097	40 %	20 %	40 %	0 %	428303474
29	NC_019727	ATT	2	6	2153	2158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303474
30	NC_019727	CCT	2	6	2203	2208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303474
31	NC_019727	AATG	2	8	2236	2243	50 %	25 %	25 %	0 %	428303474
32	NC_019727	CAT	2	6	2291	2296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303474
33	NC_019727	ACT	2	6	2322	2327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303474
34	NC_019727	CTT	2	6	2418	2423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303474
35	NC_019727	AAC	2	6	2445	2450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303474
36	NC_019727	GAT	2	6	2481	2486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303474
37	NC_019727	GCTC	2	8	2602	2609	0 %	25 %	25 %	50 %	428303474
38	NC_019727	AAG	2	6	2645	2650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303474
39	NC_019727	TATT	2	8	2719	2726	25 %	75 %	0 %	0 %	428303474
40	NC_019727	GGA	2	6	2861	2866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303474
41	NC_019727	TGT	2	6	2940	2945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303474
42	NC_019727	TGG	2	6	2950	2955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303474
43	NC_019727	A	7	7	3058	3064	100 %	0 %	0 %	0 %	428303474
44	NC_019727	GAA	2	6	3073	3078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303474
45	NC_019727	TAG	2	6	3161	3166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303474
46	NC_019727	A	6	6	3352	3357	100 %	0 %	0 %	0 %	428303474
47	NC_019727	ATT	2	6	3361	3366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303474
48	NC_019727	GAG	2	6	3401	3406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303474
49	NC_019727	GGTT	2	8	3441	3448	0 %	50 %	50 %	0 %	428303475
50	NC_019727	AG	3	6	3449	3454	50 %	0 %	50 %	0 %	428303475
51	NC_019727	TAC	2	6	3470	3475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303475
52	NC_019727	CCAT	2	8	3519	3526	25 %	25 %	0 %	50 %	428303475
53	NC_019727	GTTG	2	8	3535	3542	0 %	50 %	50 %	0 %	428303475
54	NC_019727	ATT	2	6	3554	3559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303475
55	NC_019727	ACT	2	6	3575	3580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303475
56	NC_019727	ACG	2	6	3583	3588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303475
57	NC_019727	GAAG	2	8	3607	3614	50 %	0 %	50 %	0 %	428303475
58	NC_019727	TGC	2	6	3679	3684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303475
59	NC_019727	ACGGGA	2	12	3742	3753	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	428303475
60	NC_019727	TGTT	2	8	3795	3802	0 %	75 %	25 %	0 %	428303475
61	NC_019727	CTACA	2	10	3818	3827	40 %	20 %	0 %	40 %	428303475
62	NC_019727	AGT	2	6	3859	3864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303475
63	NC_019727	TGG	3	9	3871	3879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303475
64	NC_019727	GGT	2	6	3889	3894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303475
65	NC_019727	GAA	2	6	3944	3949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303475
66	NC_019727	T	6	6	3969	3974	0 %	100 %	0 %	0 %	428303475
67	NC_019727	AT	3	6	4006	4011	50 %	50 %	0 %	0 %	428303475
68	NC_019727	TGG	2	6	4038	4043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303475
69	NC_019727	AAC	2	6	4122	4127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303475
70	NC_019727	TAC	2	6	4177	4182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303475
71	NC_019727	AAATT	2	10	4296	4305	60 %	40 %	0 %	0 %	428303475
72	NC_019727	CG	3	6	4330	4335	0 %	0 %	50 %	50 %	428303475
73	NC_019727	GTC	2	6	4646	4651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303476
74	NC_019727	TGTA	2	8	4695	4702	25 %	50 %	25 %	0 %	428303476
75	NC_019727	T	6	6	4711	4716	0 %	100 %	0 %	0 %	428303476
76	NC_019727	TTC	2	6	4723	4728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303476
77	NC_019727	A	7	7	4730	4736	100 %	0 %	0 %	0 %	428303476
78	NC_019727	TCT	2	6	4742	4747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303476
79	NC_019727	AGC	2	6	4861	4866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303476
80	NC_019727	T	6	6	4869	4874	0 %	100 %	0 %	0 %	428303476
81	NC_019727	ACC	2	6	4881	4886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303476
82	NC_019727	AT	3	6	5009	5014	50 %	50 %	0 %	0 %	428303476
83	NC_019727	CAT	2	6	5213	5218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303477
84	NC_019727	TGC	2	6	5285	5290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303477
85	NC_019727	CAA	2	6	5291	5296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303477
86	NC_019727	CTA	2	6	5307	5312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303477
87	NC_019727	A	6	6	5374	5379	100 %	0 %	0 %	0 %	428303477
88	NC_019727	CAT	2	6	5393	5398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303477
89	NC_019727	ATT	2	6	5411	5416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303477
90	NC_019727	A	6	6	5428	5433	100 %	0 %	0 %	0 %	428303477
91	NC_019727	CTA	2	6	5455	5460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303477
92	NC_019727	TGC	2	6	5474	5479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303477
93	NC_019727	CTA	2	6	5487	5492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303477
94	NC_019727	CTG	2	6	5614	5619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303477
95	NC_019727	CA	3	6	5621	5626	50 %	0 %	0 %	50 %	428303477
96	NC_019727	TCCT	2	8	5658	5665	0 %	50 %	0 %	50 %	428303477
97	NC_019727	CTA	2	6	5676	5681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303477
98	NC_019727	A	6	6	5706	5711	100 %	0 %	0 %	0 %	428303477
99	NC_019727	CAA	2	6	5714	5719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303477
100	NC_019727	TGC	2	6	5789	5794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303477
101	NC_019727	AAC	2	6	5803	5808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303477
102	NC_019727	TA	3	6	5825	5830	50 %	50 %	0 %	0 %	428303477
103	NC_019727	TATG	2	8	5891	5898	25 %	50 %	25 %	0 %	428303477
104	NC_019727	TGA	2	6	5923	5928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303477
105	NC_019727	A	7	7	5928	5934	100 %	0 %	0 %	0 %	428303477
106	NC_019727	TGG	2	6	6042	6047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303478
107	NC_019727	CAA	2	6	6083	6088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303478
108	NC_019727	AAATT	2	10	6149	6158	60 %	40 %	0 %	0 %	428303478
109	NC_019727	AACC	2	8	6166	6173	50 %	0 %	0 %	50 %	428303478
110	NC_019727	ATG	2	6	6266	6271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303478
111	NC_019727	TAC	2	6	6274	6279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303478
112	NC_019727	CTG	2	6	6496	6501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303478
113	NC_019727	A	6	6	6526	6531	100 %	0 %	0 %	0 %	428303478
114	NC_019727	ATG	2	6	6629	6634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303478
115	NC_019727	ATG	2	6	6662	6667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303478
116	NC_019727	A	6	6	6679	6684	100 %	0 %	0 %	0 %	428303478
117	NC_019727	GAA	2	6	6711	6716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303478
118	NC_019727	AAT	2	6	6724	6729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303478
119	NC_019727	AGA	2	6	6741	6746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303478
120	NC_019727	CCG	2	6	6791	6796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303478
121	NC_019727	TTA	2	6	6823	6828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303478
122	NC_019727	CAA	2	6	6847	6852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303478
123	NC_019727	TCAAA	2	10	6969	6978	60 %	20 %	0 %	20 %	428303478
124	NC_019727	ATC	2	6	6999	7004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303478
125	NC_019727	ACC	2	6	7020	7025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303478
126	NC_019727	GCT	2	6	7033	7038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303478
127	NC_019727	GAT	2	6	7090	7095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303478
128	NC_019727	ATT	2	6	7122	7127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303478
129	NC_019727	CTT	2	6	7144	7149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303478
130	NC_019727	CAT	2	6	7340	7345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303479
131	NC_019727	CGT	2	6	7380	7385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303479
132	NC_019727	ATT	2	6	7444	7449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303479
133	NC_019727	TAA	3	9	7550	7558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303479
134	NC_019727	CAAT	2	8	7594	7601	50 %	25 %	0 %	25 %	428303479
135	NC_019727	CAA	2	6	7809	7814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303479
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264	NC_019727	AACT	2	8	14627	14634	50 %	25 %	0 %	25 %	428303481
265	NC_019727	CATT	2	8	14698	14705	25 %	50 %	0 %	25 %	428303481
266	NC_019727	ATC	2	6	14715	14720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303481
267	NC_019727	TAA	2	6	14855	14860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303481
268	NC_019727	ATC	2	6	14895	14900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303481
269	NC_019727	T	6	6	14920	14925	0 %	100 %	0 %	0 %	428303481
270	NC_019727	CAA	2	6	14969	14974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303481
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272	NC_019727	CAT	3	9	15188	15196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303481
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282	NC_019727	CTT	2	6	16235	16240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303482
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302	NC_019727	AATA	2	8	17631	17638	75 %	25 %	0 %	0 %	428303483
303	NC_019727	ATAA	2	8	17666	17673	75 %	25 %	0 %	0 %	428303483
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